孙思邈卒于682年唐高宗永淳元年，享年141岁。根据《续仙传·隐化·孙思邈》记载：“二月十五日，晨起沐浴，严其衣冠，端然而坐。”临终嘱令薄葬，不要陪葬品，祭祀不要牲畜。据《旧唐书》记载，他死后“经月余，颜貌不改，举尸就木，犹若空衣，时人异之。”
这些异相，可能是因为孙思邈长期练气功并且服用药物，让他的器官发生变化的缘故。这并不奇怪，古人很早就有关于人体不腐的相关研究。
孙思邈幼年时体弱多病，“幼遭风冷”、“屡造医门，汤药之资，罄尽家产”，医药费用几乎耗尽家产，但是他资质聪明，自幼好学。
据《旧唐书·孙思邈传》记载：孙思邈“七岁就学，诵千余言”。是说他七岁开始识字读书，儿童时代能诵千余言。
十几岁时，“独孤信见而叹曰，此圣童也”。十八岁开始习医，“吾十有八而志学于医”。他幼年曾患寒疾，在亲身经历疾病的痛苦，感受社会疫病流行、缺医少药的苦难之后，他立志学医普救百姓。
二十岁，崇尚老子及百家之说，兼好释典，大有“弱冠弄柔翰，卓犖观群书”《文选·左思咏史诗》。的气概。故《旧唐书·孙思邈传》谓之：“弱冠善谈庄老。”他那时开始研究道教。孙思邈自谓：“青之岁，高尚兹典。”
孙思邈刻苦钻研医学经典，中年行医，非常重视民间经验，求知若渴勤于思考，“故知方药本草，不可不学”，往往因一方一药，不远千里去虚心请教。为切脉、诊病、处方、锚药拜访求教；“驰百金而徇经方”，为一秘方不惜重金而购得。三十七岁，“周宣帝时，思邈以王室多故，乃隐居太白山”，采集药材，进行加工制作。
据说，孙思邈养着一头毛驴，他平时到深山采药或到远处为群众治病时，就赶上这头驴为他驮载药囊、药材等；他走困了，就骑上毛驴代步。他非常喜爱这头毛驴，一步也离不开它。
有一年夏天，他和徒弟赶着这头驴到离家乡不远的五台山去采集药材。来到一处山谷口，发现药材很多，就将毛驴拴在树上，然后进山沟采药去了。
他们走了不大一会儿，忽然一只猛虎大叫一声，从松林里跑出来，直扑毛驴，用两只前爪将毛驴压倒在地，张开血盆大口，吃掉了这头毛驴。
孙思邈和他的徒弟闻声赶来时，老虎已经跑得没影没踪了，只见地上血肉模糊，剩下一大堆横七竖八的驴骨头。这头毛驴被老虎吃掉，眼下采集的一大堆药材如何运回去呢？今后采药、出诊又怎么办呢？孙思邈非常生气。
说来奇怪，那只吃了毛驴的老虎走了没多大功夫，又慢慢地走了回来。它站在孙思邈的面前，垂下了头，眼中流露出哀求的神色，口角流着鲜血，温顺得简直像只猫。
孙思邈详细观察了一会儿，看出这只老虎已经有了伤，是前来找他治疗的。但他知道这只虎吃掉了他的毛驴，孙思邈很生气，便不理睬它，转过身向远处走去。可是这只虎也跟着他走，眼里流着泪水，看样子喉咙里实在疼得难以忍受了。
孙思邈看见老虎有悔过的样子，便叫徒弟去看看虎口里有什么病。徒弟走到老虎跟前，将医铃放人虎口。把虎嘴撑开，定睛一看，原来一根骨签扎在了老虎的喉壁上，鲜血不住地向外流着。孙思邈从虎口伸进一只手去，很快就把那根骨签取了出来。
老虎的伤病被治好以后，孙思邈就指着老虎训斥道：“你这个作恶多端的野兽，吃掉了我的毛驴，被骨签刺伤了喉咙，乃是自作自受。我本来不愿给你医治，但见你疼痛难忍，且有悔过之意，才给你治好了病。你现在快走吧！”
老虎走去不远，又返回来走到孙思邈的面前卧了下来，作出让孙思邈乘骑的姿势。
孙思邈与徒弟看见老虎的表情，想了一会也就明白了。徒弟对老虎说：“你若是愿意代替毛驴为我师父驮药的话，就把头点三下”。
他刚说完，老虎果真点了三下头。于是，徒弟便将他们采集的药材搭在老虎背上。老虎这时看了看孙思邈，还是不走。
徒弟又对它说：“你难道还要把师父一起驮上吗？”
老虎听后又点了三下头。孙思邈见老虎愿意驮他，就骑在老虎的背上。这时老虎才站立起来，迈步向前赶路了。从此以后，这只虎就经常给孙思邈驮载药囊、药材，还让他骑在背上到各地给人们看病。他们师徒二人有时在深山老林里遇见盗匪、猛兽，由于这只老虎跟着，盗匪、猛兽也不敢前来伤害他们。
现在，耀州药王山上还有一块地方叫“老虎坪”。相传就是孙思邈救这只老虎的地方。后来人们给孙思邈塑像时，总要塑一只老虎卧在孙思邈身边，也就是这个原因。
581年，即隋开皇元年。二十二岁时，他对古典医学有深刻体会，能领悟和掌握医学知识及技能，开始在亲邻内外行医治病，因疗效好而在民众中享有很高的威信，声望日著。
他不仅研究医书，对诸子百家以及佛道典籍，也有所涉猎，善谈庄老及百家之说，博览经史，知识渊博。《要方·解毒并杂治·解五石毒》载“余年三十八九，尝服五六两乳”，《要方·胆腑·万病丸散》载“太乙神丹，余以大业中，数以合和而苦雄黄、曾青难得。后于蜀中遇雄黄大贱。又于飞鸟、玄武大获曾青”，《续仙传·隐化，孙思邈》载“隐于太白山，学道、炼气、养形、求度世之术”，综合上述史料可知，孙思邈有进行修道炼丹之事。
在南北朝时，很多人因为服食五石散而丧命。孙思邈没见过五石散的完整配方，但是他在《备急千金要方》中却说过：宁食野葛，不服五石。
为啥说这话呢？因为孙思邈曾见过一个五石散的残方，根据那个方子推测，五石散最后一味是剧毒的礜石。礜石含有砷，这玩意是砒霜的原料，可见真的很毒。
晚年孙思邈见到了张仲景《伤寒杂病论》的残本，证明了自己的推测。孙思邈倒是没有烧毁这个方子，而是对五石散进行了改进，把剧毒的礜石拿掉，改成了比较温和的石硫磺。方子的毒性大大降低了。
孙思邈去世后虽然也有人服用五石散，但是服用的是孙思邈改良过的配方，致死率大大降低了。五石散是禁绝不了的，孙思邈只能保证自己或者自己的家人不吃。
所以说孙思邈临终让人毁去五石散的方子，大约他想毁去的是含有礜石的剧毒五石散方子吧。五石散在唐朝并没有禁绝，还有人在服用，崔玄亮和韩愈疑似吃的就是五石散，尤其崔玄亮，经冬不衣绵，这症状典型的吃五石散后的症状。
所以孙思邈后，五石散依旧流行。作为一个负责任的医家，我觉得他不会把五石散一棒子打死，也打不死。他用自己的丰富知识去改进这个方子，让矢志服用的人死的少一些，再少一些，无法改变现状，但是可以改良。
孙思邈研制医治恶疾、癫痫温疟、癫狂、尸疰等疑难重症的丹药，只因雄黄和曾青难得，量剂不足，几次实验都未能成功。
之后，孙思邈隐居青华山深研医理，继续探究，终于在蜀县魏家研制成有名的太一神精丹。孙思邈三十岁时为丰富自己的才学长途跋涉，四处拜师。
据《酉阳杂俎》卷二：“孙思邈尝隐终南山，与宣律和尚相接来往，互参宗旨”和《湘山野录》卷下：“有处士孙思邈，常隐终南山，与宣律相接，结林下之交，每一往来，议论经久”所载，他曾和住在太白山下西铭寺的唐代精通医术的高僧宣律常相往来，虚心探求医学奥秘。交流学术心得，他还治愈了高尼净明吐呕久病以及令当朝太医无策的“霍乱”。
孙思邈设计由15味药材组成的人参汤，治愈因五劳七伤而久病卧床者。孙思邈一生曾“二遭热痢”。629年，他忽患热毒痢，三日后“命将欲绝”，他自处一方煎服，“入口即定”，并告诫此病应“大须慎口味”热痢要“多益黄连”。
630年，他自用有效的苍耳根茎泥膏救治疔肿患者。633年，孙思邈突“头痛目眩，额左角上如弹丸大肿痈，不得手近，几致殒毙”，左额丹毒，且致全身热痛，县令以种种药方治疗无效，几乎毙命，七天后孙思邈自处“治丹神验方”治疗，结果“其验如神”。
635年，汉阳王李元昌患腹水，孙思邈以“治大腹水肿气息不通命在旦夕方”治疗了几日就转危为安，还指出李元昌“差后有他犯因尔殂矣”，果然此人后因谋反罪敕令自尽。636年，梓州刺史李文博因久服石药，导致其消渴病加剧而死，曾为其服用枸杞汤病有好转。
以孙思邈对防治消渴病的丰富经验和独到见解，他指出“但不能长愈”，并认为该病如能在饮食、房室、咸食及面三项事情上谨慎从事，“虽不服药也自无他”，否则难以救治。
多年来他在秦岭、巴山之间不辞劳苦采药治病，解救重危病患，曾治疗600余名麻风病人，其中有士大夫和其他民族的名人，而且“亲自抚养”，治愈60多人。关于孙思邈救人，还有许多流传的故事。
巴山上生长着榧树、猴樟、栒子、桑树等高高矮矮的植物。在这茫茫的林海里还住着猴子、兔子、鹿、野猪等动物。
这天，一位身裹兽皮的健壮猎人蹑手蹑脚地走进了山林。他瞪着一双机灵眼晴四下里探望，手中弓箭随时准备射穿猎物的身体。突然，从草丛中窜出一只野猪，直冲猎人，猎人“唿”地一声射出一箭，箭中猪首！
负伤的野猪更加疯狂了，一下了扑到猎人面前，猎人急忙躲避。但这只身强力壮的野猪，拼命地冲锋，撞伤了猎人的肩膀、胸部和手臂。
猎人大吼一声，抽出随身短刀砍向野猪，野猪蹬腿身亡，猎人也身负重伤，昏倒在地。等他醒过来，觉得身体很疼痛，低头一看前胸的兽皮被撕破，皮肉开裂，鲜血直流；肩头也有阵阵钻心般的疼痛，他摸出自带的伤药敷在伤口上，但伤口太多，太深，金创药止不住血，也止不住痛啊！他心想：“今天恐怕要与这野猪同归于尽了。”
猎人想到家中的妻儿，不甘心就这么死去，他痛苦地呻吟着：“呦，呦，呦，呦……”
他好像一只失群的幼鹿在呼唤它的母亲快来救援一般。让那“幼鹿”柔和而又带点凄楚的呼唤声，透过树枝草叶，传向远方。
一只年轻的母鹿出现了！它匆匆赶来，要找回自己失落了的“孩子”。可是它赶到幼鹿呼唤声的地方后，怎么不见自己“孩子”呢？它昂起头来惊讶地回顾寻觅……
这时猎人早已拿出自己的弓，并搭上了箭在草丛中暗暗地瞄准了母鹿的颈部！他在心中暗暗祈祷：“箭呀箭，再莫误我，一箭射死此鹿，让我用热鹿血救己一命！”
说完。使出吃奶的力气拉开了弓，肩臂的伤疼痛，他紧咬牙关拉弓张弦，手微微地颤动着，只听“唿”地一声母鹿惨叫着应声倒地，猎人也因用力过猛昏死过去。
过了一会儿，母鹿见无动静，便悄悄抬起了头。原来因猎人手臂受伤颤动，箭未能射中母鹿的要害，仅射中了它的右前腿。只见它用嘴在草丛中翻动、寻找，不一会儿咬断了几枝开着黄色小花的野草，放到腿边，再用嘴咬住箭杆使劲往出拔。
箭被母鹿从腿上拔出来后，它咬碎了那几株开着黄色小花的野花敷在自己的伤口上，伤口上的血被止住了！它又在草丛中找到几株开着黄花的野草含在口中咀嚼着……
这时，猎人再次苏醒过来，他发现那母鹿没死，急忙对准母鹿的头狠命拉开了弓，他想，这次一箭射去，母鹿准死无误。当他正要放箭时，手臂被谁从后边拨开了，箭飞出去，扎在一株古松上。猎人一惊，回头一看，只见一位面容清瘦的采药老人，不由得发怒了：“你，为什么拦我射鹿？”
“我要及时救你的命啊！”采药老人和蔼地说。
“你是谁？”
“我是孙思邈。”
“你是药王？可草药已治不了我身上的伤了。你为啥拦阻我杀鹿喝血治伤？你不是说救人一命等于施舍千金，为什么为救一只鹿而要我丧命？”
孙思邈并不辩解，轻轻地扶他躺下，然后快速奔到母鹿跟前。这时母鹿已慢慢地站立起来了，母鹿嘴里还衔着两株开着黄色小花的野草。
孙思邈走上前去一边抚摸鹿背，一面观察鹿的箭伤，又细看鹿嘴里的野草。母鹿像颇解人意似的，伸过头来把口里衔的野草吐在孙思邈手中，然后昂头“呦呦”地叫了一声，扬起四蹄跑开了，不一会就隐没在树林深处。
孙思邈依着手中的草样子，在草丛中，树荫下又采集了一大把开着黄色小花的野草，回到猎人身边。孙思邈把野草放在自己口中嚼成糊状，敷在猎人的伤口上，伤口顿时就不疼了！
孙思邈又让猎人吃了一些撕碎的草。不一会儿，猎人自己能站起来了，伤痛几乎全好了。
猎人向孙思邈深深作了个揖，感谢说：“真不知该怎样报答你的救命之恩，这只野猪送给你吧！请收下吧！”
孙思邈摇摇手说：“使不得，使不得，你拼得性命猎的野猪，是养家糊口之物，我不能要。再说，救你的，不是我孙思邈。”
“不是你药王爷，是谁？”
“是那只你要杀的母鹿，是它的草药救了你。”孙思邈说：“不少动物都认识几种救己病的草药。比如地上的蜥蜴如被蛇咬伤了，自己就找一种名叫蛇根草的草药给自己解毒治伤。据说灵角龟之所以长寿，是因为它吃了人参和灵芝之故。所以鹿认得疗伤的草药也就不奇怪了。我多年在深山老林中采药，也碰到过口衔着野草奔跑的鹿儿，可不知它衔的是什么草？今日方解此谜，又给人增加了一味治伤的药啊！要说该感谢你哪，是你使我认识这种草药啊！”
孙思邈把一株开黄色小花的草药递给猎人说：“记住这种鹿衔过的草药吧，你们猎人，以后还能用上。”
猎人接过草药，问道：“这草药叫啥名字呢？”
孙思邈沉思了片刻说：“就叫鹿衔草吧！”
从此这种治跌伤损伤的草药就以鹿衔草的名字在民间流传着。
孙思邈对药物学的见解更有独到之处。他注重采药季节，否则，药草和普通花草很难区分，会徒劳无功；他列出233种药品，注明几月采，甚至注清哪时节采根、哪时节采花和茎。他列出680种常见药，建议随时采集以备不时之需。
此外，他还强调产地要清楚，列出基本囊括所有地方的133个州，共计有519种道地药物。这样具体、详细、全面的见解论述，在药物学上孙思邈是首创，后人因此称誉他为“药王”。
孙思邈对营养缺乏病的治疗也超过前人。唐代以前的医家对因缺碘所引起的甲状腺肿大，主张用海藻、昆布一类含碘的植物去治疗，孙思邈创新了用口服动物的甲状腺去治疗。
而且，对由于人体缺乏维生素B而导致的脚气病，孙思邈最擅长。他用含有大量维生素B1的多种药物来煮汤服用，并起到了很好的治疗和预防作用。孙思邈在七世纪对这种病做了详细描述，并掌握了正确的治疗和预防方法。
相传，唐时长安城内有几个富翁身患一种奇怪的疾病，只见脚胫日趋浮肿，浑身肌肉酸痛麻木，身倦乏力，众医诊治均束手无策。于是请孙思邈诊治，经药石下肚，仍不见转机，孙思邈由于难揭其谜，终日甚感不安。
有一天，严太守也患此病请孙思邈治疗，为了查明病因，他住进严府中仔细观察了十几天，只见严太守的贴身家丁也同样精神萎靡不振，下肢照样浮肿，只是比严太守稍轻些。
孙思邈仍百思不得其解，他又到厨房内调查，厨师说严太守不喜欢大鱼大肉，但他对粮食精制特别讲究，派人将米面反复加工精碾细磨后才作为主粮食品。
随后孙思邈又去拜访了其他几位同样症状的富翁，发现都有同样习惯喜食精粮，此时孙已领悟出其中的玄妙了。孙思邈立即建议严太守将每日主食全改成粗粮糙米，并且将一些细谷糠、麦麸皮煎水服用，半月之后这种疑难病竟神奇康复了，病人精神好转，浮肿全消退了。消息一传出，长安城内外市民一片震惊，赞扬孙思邈真是天下神医！孙思邈终于将谜揭穿，他用食疗方法成功治愈因精粮引起的“脚气病”，在他潜心编写的医学巨著《千金要方》和《千金翼方》中有详细的记载。
其中《千金要方》中收载有果实、蔬菜、谷米、鸟兽共计154种食物和性味、功能及主治病症的内容，最先提出用食物治病的科学理论，为传统医学“食疗法”的发展奠定了基础。
孙思邈虚心学习和研究总结前代名医如秦越人、张仲景、华佗、葛洪、支法存的理论和经验，经过个人的实践摸索，在吸收继承中又有发展和创新。孙思邈在各科疾病的防治、针灸、药物、方剂、食疗、养生以及中医基础理论和诊治法则等方面，都有深厚的造诣独特的风格。
